イワシタ　ハナコ   Iwashita Hanako   岩下　華子    所属   医学部 医学科    職種   助教
論文種別	原著
言語種別	英語
査読の有無	査読あり
表題	Analysis of Vibrio seventh pandemic island II and novel genomic islands in relation to attachment sequences among a wide variety of Vibrio cholerae strains
掲載誌名	正式名：Microbiology and Immunology ISSNコード：03855600
掲載区分	国外
出版社	John Wiley & Sons Australia, Ltd
巻・号・頁	62(3),pp.150-157
著者・共著者	Nguyen Tuan Hai, Pham Tho Duc, Higa Naomi, Iwashita Hanako, Takemura Taichiro, Ohnishi Makoto, Morita Kouichi, Yamashiro Tetsu
発行年月	2018/03
概要	ビブリオコレラ菌株におけるVibrio第7次パンデミックアイランドII(VSP-II)の種類、分布、ゲノムに組み込まれたVSP-IIの上流に形成されるattachment sequence left(attL)について、次世代型シークエンサーで解析を行った。その結果、解析したビブリオコレラ菌株188株のうち178株は、当研究所のカルチャーコレクションに収集・保存されている菌株で、アジアやアフリカ諸国からの単離株であった。また、188株のうち153株がVSP-IIを保有しており、そのうち55株が典型的VSP-IIを保有し、96株がVC0495-VC0498欠失を有する短躯型VSP-IIを保有していた。なお、残りの2株は非O1/非O139で、これらの株からは新規VSP-IIが検出された。以上の解析結果から、VSP-IIを保有する153株のうち139株が典型的な14bpのattLを保有し、残りの14株は新規6種類の13bpのattL様配列を保有していることが明らかにされた。さらに、第7次パンデミック株のうち1～2種類のattL様配列が観察されたwave2やwave3株とは異なり、wave1株からは6種類全てのattL様が認められ、6種類の新規ゲノムアイランドが確認された。
DOI	10.1111/1348-0421.12570
文献番号	2019023993